Après une réinstallation d'un Windows (par exemple) votre secteur d'amorçage ce trouve cassé, il faut donc le réparé… pour cela munissez vous d'un live-cd

Monter votre partition linux si cela n'est pas déjà fait! (puis éventuellement votre /dev)
mount /dev/hda1 /mnt/hda1
mount -o bind /dev /mnt/hda1/dev

Faite un Chroot pour entrer dans votre système
chroot /mnt/hda1

Entrer dans le grub-shell :
grub

Puis réinitialiser votre secteur d'amorçage :
grub> root (hd0,0)
grub> setup (hd0)

Une fois redémarrer éditer le fichier /boot/grub/menu.lst et ajouter la ligne suivante pour pouvoir booter sur Windows
rootnoverify (hd0,1)
chainloader +1